A la création de l’empire Mongol, toute la population est tournée vers le Tengrisme, le culte de Gengis Khan, qui avait été accepté dans le « Tengri », le panthéon le plus élevé des esprits du chamanisme mongol. Culte tourné vers les forces et esprits de la nature et des animaux.
Le bouddhisme arrive en Mongolie pour la première fois sous la dynastie Yuan (XIIIe-XIVe siècle) et a été brièvement instauré en tant que religion officielle dans le pays, avant de passer en second plan, face à la pratique du Tengrisme. C’est à la fin du XVIe siècle, lorsque Altan Khan se converti, que le bouddhisme est rétabli. En 1691, après l'annexion de la Mongolie extérieure par la dynastie Qing, le bouddhisme est devenu la religion dominante de toute la région et le chamanisme a commencé à intégrer des éléments bouddhistes. Au XVIIIe siècle, la résistance violente des tribus de du nord de la Mongolie contre le groupe dominant des «Mongols Khalka» (bouddhiste), a conduit à une mixité des pratiques et à la création du chamanisme noir.
Pendant la domination soviétique de la République populaire de Mongolie, toutes les formes de chamanisme où Bouddhisme, ont été réprimées et de très nombreux chamanes et Lamas ont été tués durant les purges soviétiques.
A cette même époque, de très nombreux monastères et complexes monastiques sont détruits en quasi-totalité. Après 1991, à la chute du système soviétique, que le Bouddhisme a fait son retour, prenant le pas sur le chamanisme. A l’heure actuelle, le chamanisme fait son retour et des recherches récentes menées par des anthropologues ont montré que le chamanisme fait partie intégrante de la vie spirituelle mongole.
Quelques rares monastères ont été épargnés et certains autres été partiellement rénovés, voici quelques-uns des monastères les plus importants du pays.

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